2017年7月31日 星期一

(7) 蛋白質如何運送至溶酶體(lysosome) 07-29-2017


(7) 蛋白質如何運送至溶酶體(lysosome)

 

一、   溶酶體(lysosome)之特性

(1)     溶酶體是細胞內的廢物處理場(junk yard);自殺袋(suicide bag)


 

01. 圖綠色部分為瀕臨死亡之神經元(Neurons),神經元內紅色圓球狀胞器就是溶酶體(Lysosomes)


 

(2)     溶酶體內有六大類的酸性水解酶(acidic hydrolases),酶(=酵素)均為蛋白質組成,溶酶體內共約有50種的酵素。

1核酸酶(NucleasesDNAase, RNAse)

2蛋白酶(Proteases:膠原蛋白酶(Collagenase), 組織蛋白酶

   (Cathepsins) etc.)

3脂酶(Lipases) & 磷脂酶(phospholipases)

4磷酸酶(Phosphatase)

5硫酸酶(sulphatases)

6糖苷酶(Glycosidases):β-葡萄糖苷酶(β-glucosidase),己糖胺酶A

  (hexoaminidase A),α-甘露糖苷酶(α-mannosidase)

(3)     溶酶體是單層膜雙層磷脂的胞器,磷脂層鑲嵌或附著大量醣蛋白。

   主要為兩大類:

    1highly glycosylated lysosomal associated membrane proteins(LAMP)

      高度糖化之溶酶體膜的相關蛋白質

    2highly glycosylated lysosomal integral membrane proteins(LIMP)

      高度糖化之溶酶體膜的整體蛋白質

(4)     本文探討溶酶體內六大類酵素以及LAMP, LIMP等等的蛋白質,在粗糙內質網(RER)結合態核醣體(bounded ribosomes)合成後,是如何經由平滑內質網(SER),高基氏體進入到溶酶體?

(5)     溶酶體內六大類酵素均為酸性水解酶,因為溶酶體內pH值在4.85.0之間。


 
 

02. 溶酶體是以胞器膜上之氫離子幫浦(H+ pump),耗能將H+主動打入溶酶體內,以維持pH值~5.0之酸性環境。


 

二、蛋白質如何由高基氏體運送至溶酶體內?

甘露糖-6-磷酸(Mannose-6-phosphate, M-6-P)及其接受器是大部分酸性水解酶由高基氏體運送至溶酶體內的方式:
1.  溶酶體(Lysosome)內的大部分酸性水解酶(hydrolase),在粗糙內質網(RER)合成後,送至高基氏體的順式區(Cis Golgi Network, CGN)就與M-6-P結合。
2.  再送至反式高基氏體(Trans Golgi Network, TGN),膜上有M-6-P接受器(M-6-P receptor),相互結合後經由網格蛋白外套(clathrin coat)包覆。
3.  出芽(Budding)形成胞內體(Endosome)
4.  胞內體併入溶酶體中,M-6-P接受器能送回反式高基氏體重複使用。

 


 

03. 送往溶酶體的蛋白質,是以甘露糖-6-磷酸(Mannose-6-P)為標記(Marker),在反氏高基氏體(Trans Golgi Network, TGN),與甘露糖-6-磷酸接受器(Mannose-6-P receptor)結合形成胞內體(endosome),然後進入溶酶體中。


 


 

04. 大多數酸性水解酶(Acid Hydrolases)由高基氏體運送至溶酶體內的通則。


 



05. 反式高基氏體(Trans Golgi Network, TGN),膜上有M-6-P接受器(M-6-P receptor,綠色)M-6-PM-6-P接受器相互結合後,經由網格蛋白(clathrin,紅色)包覆,形成網格蛋白外套囊泡(clathrincoated vesicle)。請看圖06.

圖片來源:


 


 

06. 於反式高基氏體(trans Golgi network, TGN),甘露糖-6-磷酸(Mannose-6-Phosphate)與甘露糖-6-磷酸接受器(Mannose-6-Phosphate receptor)結合,經由網格蛋白(clathrin)包覆,出芽(Budding)後,形成網格蛋白外套囊泡(clathrincoated vesicle)

圖片來源:


 

三、 溶酶體之功能:

(1) 細胞內吞作用(Endocytosis)進入細胞之小分子,或細胞胞噬作用

    (Phagocytosis)進入細胞之大分子,最後都經由溶酶體中的酵素分解。

(2) 細胞內用舊的胞器(e.g.粒線體),經內質網(ER)包覆後,形成次級溶酶體

    (Secondary Lysosome),將胞器分解有用的分子重複使用,此過程稱為自噬

    作用(Autophagocytosis)

(3) 參與程式性細胞死亡(ApoptosisProgrammed Cell Death)

(4) 精子頭部之穿孔體(Acrosome)是特化之溶酶體。


 

07. 溶酶體參與之細胞內消化作用(Intracelluar Digestion)

圖片來源:


 


 

08. 精子頭部之穿孔體是特化的溶酶體(Lysosome)


 

四、溶酶體儲存疾病(Lysosomal Storage Disease)

溶酶體儲存疾病是因為

(1) 溶酶體內的分解酵素基因突變

(2) 由高基氏體將這些分解酵素運送至溶酶體的蛋白質基因突變

    e.g.磷酸轉移酶(Phosphotransferase)基因突變→無法在高基氏體形成甘 

    露糖六磷酸(M-6-P)→許多的水解酶無法運送至溶酶體→許多巨分子無法分

    解只好儲存於溶酶體,尤其是纖維母細胞(Fibroblast)形成包涵體

    (Inclusion Bodies)→引起I-Cell disease

 

    ※甘露糖六磷酸(M-6-P)是高基氏體分辨分配至溶酶體(Lysosome)蛋白質之

    標記(Marker)


 

09. I-Cell disease是因為磷酸轉移酶(Phosphotransferase)基因突變→無法在高基氏體形成甘露糖六磷酸(M-6-P)→許多的水解酶因為缺乏運送至溶酶體的標記,而分泌到血漿中→溶酶體缺乏水解酶→無法分解巨分子而儲存之,引起的疾病。

2017年7月29日 星期六

(6) 蛋白質如何運送進入粒線體 07-29-2017


      蛋白質如何運送進入粒線體



一、前言

    真核細胞(eukaryote)的蛋白質合成,也就是轉譯(Translation),是在細胞質(cytoplasm)的核糖體(Ribosomes)上進行。

    真核細胞中有兩種核醣體:

1.  一種與粗糙內質網(RER)結合稱為結合態核醣體(bounded ribosomes)

2.  一種為遊離在細胞質液(Cytosol)中稱為遊離態核醣體(free ribosomes)

3.  結合態核醣體合成的蛋白質先送入粗糙內質網(RER),再傳送到平滑內質網(SER),最後傳送到高基氏體「包裝」之後,分別「分配」到溶酶體(e.g.消化酶);細胞膜表面(e.g.接受器)或分泌至細胞外(e.g.激素)

4.  游離態核醣體合成的蛋白質則以訊號胜(Signal peptide)以及伴侶蛋白(Chaperonins)的機制分配到粒腺體等胞器中或細胞核內。

5.  總結的說,真核細胞核醣體合成的千萬種蛋白質,都會被井然有序的分配到細胞適當的胞器中。

6.  本文探討游離態核醣體合成的蛋白質(=前驅蛋白),如何以訊號胜、伴侶蛋白Tom complexTim complex等機制,分配到粒腺體的適當位置。






Golgi complex─高基氏體(紫色)             Cytosol─細胞質液

結合態核醣體合成蛋白質的分配命運         遊離態核醣體合成蛋白質的分配命運

有三種:                                 有四種:

1.  Secretory vesicle分泌小泡(紫色)    1.  Nucleus─細胞核(紫藍色)

2.  Lysosome─溶酶體(淡藍色)             2.  Mitochondrion─粒線體(澄色)

3.  Plasma membrane─細胞膜(黃色)        3.  Chloroplast─葉綠體(綠色)

4.                                           Peroxisome─過氧化氫小體(灰色)

01. 真核細胞(eukaryote)核醣體合成的千萬種蛋白質,都會被井然有序的分配到細胞適當的胞器中。



粒線體之結構與功能請網友參考
(4)  粒線體(Mitochondria)






02. 粒線體具有內外膜,四層磷脂層。粒線體的外膜(Outer membrane)結構與功能類似細胞膜,對物質選擇性通透(selectively permeable)。粒線體的內膜(Inner membrane)往內形成皺褶,是電子傳遞系統(ETS)存在的地方。

附記:mitochondrion是原文粒線體的單數;mitochondria是粒腺體的複數。




    人類粒線體的DNA(mtDNA)16,569 bp組成,只含有37對基因。也就是說大多數粒線體中的酵素(=酶,估計超過1,000多種),還是由細胞核中基因表現後,再送入粒線體中。這些前驅蛋白如何的運送進入粒線體?這就是本文探討的主題!



細胞質液新合成的蛋白質(=前驅蛋白)如何進入粒腺體?
1.  細胞質液(Cytosol)中合成之粒腺體蛋白質,如何認知那些胞器是粒線體?
Ans:依靠訊號胜(Signal peptide)=訊號序列(Signal sequence)
訊號序列不僅導引細胞質液中合成之蛋白質到粒腺體,還導引它們到粒腺體外膜、內膜、內外膜之間或基質等適當的位置。(the signal peptides direct the proteins to the correct mitochondrial subcompartment.)

2.  蛋白質如何進入粒腺體?如何形成具有生理功能之蛋白質?
   Ans依靠伴侶蛋白(Chaperonins) e.g. TOM complexTIM complex
        TOM complex (Translocase of the Outer Membrane complex).
        =粒線體外膜之轉位酶複合體
        TIM complex (Translocase of the Inner Membrane complex).
        =粒線體內膜之轉位酶複合體



二、伴侶蛋白(Chaperonins)





03. 粒線體外膜之轉位酶複合體(Tom complex)

Tom複合體是由Tom5Tom6Tom7Tom20Tom22Tom40以及Tom70次單位組成。

Tom 複合體主要是由三個Tom40次單位組成,三個Tom40次單位再與三個Tom22次單位連接。

每一個Tom40次單位形成一個穿越粒腺體外膜的孔道(Pore)Tom5Tom6Tom7次單位位於孔道周圍。

與前驅蛋白(Precursor proteins)結合之接受器Tom20 & Tom70在圖03.中未顯示








04. 粒線體內膜之轉位酶複合體(Tim complex)

Tim複合體是由Tim23Tim17Tim50Tim21Tim44次單位以及PAM複合體組成(presequence translocase-associated motor complex)

PAM複合體的主要功能是經由以下機制,幫助前驅蛋白質的重新皺褶(refolding)

(1)Tim44結合將粒線體熱激蛋白(mtHsp70)帶至前驅蛋白

(2)經由PAM18/16/17活化粒線體熱激蛋白(mtHsp70)ATPase活性








05.伴侶蛋白(Chaperonins)幫助新轉譯合成之蛋白質(=前驅蛋白),形成適當的皺摺(folding)以及維持皺摺的形狀,成為具有生理功能之蛋白質。

(1) 未皺摺之前驅蛋白進入伴侶蛋白的桶狀構造中。

(2) 伴侶蛋白的蓋子蓋上,在桶中形成皺摺。

(3) 伴侶蛋白的蓋子掀開,適當皺摺的蛋白質(=具有生理功能的蛋白質)釋放出來。




    伴侶蛋白(Chaperonins)是一類,能幫助其他蛋白質形成皺摺(Folding),以及維持皺摺形狀的蛋白質。
伴侶蛋白中最早被發現的是—熱激蛋白(heat shock proteins, hsp),當細胞受到壓力(stress)時產生。
    熱激蛋白包括—hsp70, hsp60, and grp78 (Glucose-regulated protein).1962年被發現。
    熱激蛋白當遇到熱、抗生素、酒精、重金屬…等刺激時含量增加。



三、 前驅蛋白如何進入粒腺體?





06. 蛋白質進入粒線體的通則。

(1)細胞質液熱激蛋白70(Cytosolic Hsc70)耗能,讓新合成的蛋白質保持不皺摺的狀態。

(2)粒線體外膜的Tom20/22接受器(Import receptor)與新合成的蛋白質(=前驅蛋白)之基質標的序列(Matrix-targeting sequence)認知。

(3)前驅蛋白經外膜之Tom40通道進入粒線體內外膜之間。

(4)再經內膜之Tim23/17通道進入基質(Matrix)

(5)基質熱激蛋白70(Matrix Hsc70)幫助將前驅蛋白拉入基質中。

(6)基質蛋白分解酶(protease)分解訊號序列(targeting sequence)

(7)形成具有生理功能之蛋白質(active protein)